Став губернатором, Леонид Коротков еще раз досадил партии власти. В марте 2005 года на выборах в парламент он создал блок "Мы за развитие Амурской области", объединивший отделения Партии жизни, "Яблока" и местное движение "За родное Приамурье". Этот блок победил на выборах, набрав на 1% голосов больше, чем единороссы.
Основанием для возбуждения уголовного дела в отношении Короткова послужили материалы Счетной палаты, куда в начале этого года поступило письмо за подписью региональных депутатов фракции "Единая Россия". Они просили СП разобраться, почему пост главы региона занимает человек, который за счет простых граждан финансирует футбольный клуб "Амур", президентом которого и является.
При проверке оказалось, что корни этой истории уходят в 2003 год, когда Коротков обратился с письмом в Региональную энергетическую комиссию РФ по Амурской области с предложением включить расходы на содержание ФК "Амур" в тариф на электроэнергию. Уже 4 декабря совет директоров ОАО "Амурэнерго" под видом благотворительной помощи подписал документ об увеличении энерготарифа для населения на 0,8 коп. за кВт ч. Новые тарифы стали действовать с 23 декабря 2003 года, и, как было установлено в ходе проверки, за 2003 – 2004 годы обладминистрация перевела на счета "Амура" 41 млн руб. Кроме этого, выяснилось, что еще 4 млн руб. были переведены со счетов обладминистрации под тем же благовидным предлогом на счета нескольких учреждений, в том числе детских. Все материалы проверки СП были переданы в Генпрокуратуру, и глава ведомства Юрий Чайка поручил прокуратуре Амурской области провести их срочную проверку.
